수감 중인 아버지가 남긴 단서, 'A'라 불리는 존재.

여동생은 정말로 마법소녀 사이트의 스틱으로 살해당한 것인가?!

'A'란 대체, 어떤 인물인가….

진상에 다가서기 위해 '살육장'을 실마리 삼아, 카요와 사카키는 마법소녀 수색에 나서는데…?!